離子色譜捕獲柱的作用是去除污染物和不需要的分析物，以防止它們干擾目標分析物。這類短捕獲柱含有高容量、低效率的離子交換樹脂。安裝在樣品和進樣器之間的專業拋光柱可以去除樣品中不需要的抗衡離子。陰離子捕獲柱利用配備淋洗液生成功能的Reagent-Free離子色譜系統（RFIC-EG）去除樣品中的所有陰離子分析物。ATC陰離子捕獲柱含高容量、低效率的陰離子交換樹脂，以去除氫氧化物淋洗液或硼酸鹽淋洗液中的痕量陰離子污染物。CR-TC持續再生陰離子捕獲柱電解再生陰離子捕獲柱在無需離線化學再生的情況下持續地從淋洗液中去除所有的陰離子污染物，并在梯度操作期間產生極低的基線漂移。ATC-HC和ATC-HC500陰離子捕獲柱高容量陰離子交換捕獲柱專為配合RFIC-EG系統柱使用而設計，以去除去離子水或RFIC-EG淋洗液中的陰離子污染物，防止這些污染物到達保護柱或分析柱。

使用 Thermo Scientific™ Dionex™ IonPac™  ATC-3 和 Dionex IonPac ATC 500 陰離子捕獲柱，可除去氫氧化物或硼酸鹽洗脫液中的痕量陰離子污染物。這些捕獲柱安裝在進樣閥之前、泵之后的淋洗液流路中，可避免在梯度操作期間生成假峰并盡量減少基線漂移。Dionex IonPac ATC 500 與 Dionex IonPac ATC-3 相同，但其包裹在柱體內，支持在高達 5000 psi (34.5 MPa) 的壓力下連續運行高壓離子色譜 Thermo Scientific™ Dionex™ HPIC™ 系統。